| 学校名(２００４年) | ２００９年 | 備考 | その他 |
| 安田学園 | |||
| 郁文館 | |||
| 烏山工 | 世田谷泉(００年開校) | ||
| 羽田 | つばさ総合 (０２年開校) |
(練習可能な場所が無いので、存在しない) | |
| 羽田工 | |||
| 王子工 | 閉校(０９年) | ||
| 海城 | |||
| 開成 | |||
| 学芸大附 | |||
| 学習院 | |||
| 葛飾商 | |||
| 葛飾野 | |||
| 葛西工 | |||
| 葛西南 | |||
| 関東一 | |||
| 岩倉 | |||
| 砧工 | 世田谷総合 (０８年開校) |
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| 玉川 | |||
| 京華 | |||
| 京華商 | |||
| 京北 | (部員少数による不参加) | ||
| 京北商 | 京北白山 | ||
| 錦城学園 | |||
| 九段 | 区九段 | (０９年に閉校→中高一貫校へ) | |
| 駒込 | |||
| 駒場 | |||
| 駒場学園 | |||
| 駒大高 | |||
| 戸山 | |||
| 向島工 | 橘 | ||
| 広尾 | |||
| 攻玉社 | |||
| 江戸川 | |||
| 江東工 | 科学技術 | ||
| 化学工 | |||
| 港工 | 六郷工科 | ||
| 紅葉川 | |||
| 荒川工 | |||
| 荒川商 | |||
| 高島 | |||
| 高輪 | |||
| 国士舘 | |||
| 桜町 | |||
| 三商 | |||
| 三宅 | |||
| 篠崎 | |||
| 芝 | |||
| 芝浦工大 | |||
| 修徳 | |||
| 淑徳 | |||
| 駿台学園 | |||
| 順天 | |||
| 小岩 | |||
| 小山台 | |||
| 小松川 | |||
| 昭和一 | |||
| 昭和鉄道 | |||
| 松原 | |||
| 城西 | |||
| 城東 | |||
| 城南 | 六本木(０５年開校) | ||
| 城北 | |||
| 京北 | |||
| 新宿 | |||
| 新島 | |||
| 深川 | |||
| 世田谷学園 | |||
| 世田谷工 | 総合工科 | ||
| 成城 | |||
| 成城学園 | |||
| 成立 | 成立学園 | ||
| 正則 | |||
| 正則学園 | |||
| 聖学院 | |||
| 青井 | |||
| 青山 | |||
| 青山学院 | |||
| 青稜 | |||
| 赤羽商 | |||
| 雪谷 | |||
| 明正 | 芦花 (０３年開校) |
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| 千歳 | |||
| 千歳丘 | |||
| 早稲田 | |||
| 巣鴨 | |||
| 足立 | (軟式野球部のみ) | ||
| 足立学園 | |||
| 足立工 | |||
| 足立新田 | |||
| 足立西 | |||
| 足立東 | |||
| 大山 | |||
| 大森 | |||
| 大森工 | 大森学園 | ||
| 大島 | |||
| 大島南 | 大島海洋国際 | ||
| 大東大一 | |||
| 筑波大駒場 | |||
| 筑波大付 | |||
| 帝京 | |||
| 田園調布 | |||
| 池袋商 | 千早 (０４年開校) |
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| 都牛込商 | |||
| 都高専 | 産業技術高専 | ||
| 都深沢 | |||
| 都立大附 | 桜修館 | ||
| 東 | |||
| 東海大高輪台 | |||
| 東京 | |||
| 東京学園 | |||
| 東京工 | 日工大駒場 | ||
| 東京実 | |||
| 東工大附工 | 東工大科技 | ||
| 東農大一 | |||
| 東洋 | |||
| 二松学舎大附 | |||
| 日体荏原 | |||
| 日大一 | |||
| 日大豊山 | |||
| 日大櫻丘 | |||
| 日比谷 | |||
| 日本学園 | |||
| 日本橋 | |||
| 八丈 | |||
| 武蔵工大付 | 東都大付 | ||
| 淵江 | |||
| 文京 | |||
| 豊島学院 | |||
| 豊南 | |||
| 墨田工 | |||
| 墨田川堤校舎 | 閉校(０３年) | ||
| 本郷 | |||
| 本所工 | 葛飾総合 (０７年開校) |
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| 水元 | |||
| 麻布 | |||
| 明治 | (０８年より西東京へ) | ||
| 目黒 | |||
| 立正 | |||
| 両国 | |||
| 國學院 | |||
| 獨協 | |||
| 目黒学院 | |||
| 国際 | |||
| 多摩大目黒 | (ＨＰ不明) | ||
| 文教大付 | |||
| 立教池袋 | (００年に併設) | ||
| 立志舎 | |||
| 東京成徳大 | |||
| 渋谷 | |||
| 朋優学院 | |||
| 大東学園 | (０３年に男女共学) | ||
| 板橋 | |||
| 蒲田 | |||
| 桐ケ丘 | (定時制の学校？) | ||
| 桜丘 | |||
| 共栄学園 | |||
| 松蔭 | |||
| 三田 | |||
| 上野学園 | |||
| 淑徳巣鴨 | |||