| 学校名(２００４年) | ２００９年 | 備考 | その他 |
| 阿智 | |||
| 阿南 | |||
| 梓川 | |||
| 伊那北 | |||
| 伊那弥生ケ丘 | |||
| 臼田 | |||
| 塩尻 | 塩尻志学館 | ||
| 岡谷工 | |||
| 岡谷東 | |||
| 岡谷南 | |||
| 屋代 | |||
| 屋代南 | |||
| 下伊那農 | |||
| 下高井農林 | |||
| 下諏訪向陽 | |||
| 茅野 | |||
| 丸子実 | 丸子修学館 | ||
| 岩村田 | |||
| 駒ケ根工 | |||
| 軽井沢 | |||
| 更科農 | |||
| 高遠 | |||
| 佐久長聖 | |||
| 犀峡(犀狭) | |||
| 坂城 | |||
| 篠ノ井 | |||
| 長野俊英 | |||
| 小海 | |||
| 小諸 | |||
| 小諸商 | |||
| 松商学園 | |||
| 松川 | |||
| 松代 | |||
| 松本蟻ケ崎 | |||
| 松本県ケ丘 | |||
| 松本工 | |||
| 松本深志 | |||
| 松本筑摩 | |||
| 松本美須々ケ丘C♀ | 松本美須々ケ丘 | ||
| 上伊那農 | |||
| 上田 | |||
| 上田西 | |||
| 上田千曲 | |||
| 上田染谷丘 | |||
| 上田東 | |||
| 信州工 | 武蔵工大二 → 東都大塩尻 | ||
| 諏訪実 | |||
| 諏訪清陵 | |||
| 諏訪二葉 | |||
| 須坂 | |||
| 須坂園芸 | |||
| 須坂商 | |||
| 須坂東 | |||
| 赤穂 | |||
| 蘇南 | |||
| 大町 | |||
| 辰野 | |||
| 池田工 | |||
| 中条 | |||
| 中野 | 中野立志館 | ||
| 中野実 | |||
| 中野西 | |||
| 長野 | |||
| 長野吉田 | |||
| 長野工 | |||
| 長野高専 | |||
| 長野商 | |||
| 長野西 | |||
| 長野東 | |||
| 長野南 | |||
| 長野日大 | |||
| 塚原青雲 | |||
| 田川 | |||
| 東海大三 | |||
| 東部 | |||
| 南安曇農 | |||
| 白馬 | |||
| 飯山照丘 | 飯山 | ||
| 飯山南 | |||
| 飯山北 | |||
| 飯田 | |||
| 飯田工 | |||
| 飯田長姫 | |||
| 飯田風越 | |||
| 富士見 | |||
| 穂高商 | |||
| 豊科 | |||
| 望月 | |||
| 北佐久農 | |||
| 北部 | |||
| 箕輪工 | 箕輪進修 | ||
| 明科 | |||
| 木曽 | 木曽青峰 | ||
| 木曽山林 | |||
| 野沢南 | |||
| 野沢北 | |||
| 蓼科 | |||
| 松本第一 | |||
| 地球環境 | (０４年に野球部創部) |