| 学校名(２００４年) | ２００９年 | 備考 | その他 |
| 羽茂 | |||
| 燕 | (廃部) | (１０年閉校予定) | |
| 塩沢商工 | |||
| 加茂 | |||
| 加茂暁星 | |||
| 加茂農林 | |||
| 海洋 | |||
| 巻 | |||
| 巻工業 | 巻総合 | (０３年に巻農と統合) | |
| 巻総合 | (すでに存在するので、削除) | ||
| 関根学園 | |||
| 柿崎 | 久比岐 | ||
| 吉川 | |||
| 吉田 | |||
| 興農館 | 閉校(０２年) | ||
| 敬和学園 | |||
| 見附 | |||
| 五泉 | |||
| 荒川 | |||
| 高志 | |||
| 高田 | |||
| 上越総合技術 | (すでに存在するので、削除) | ||
| 高田商 | |||
| 高田農 | |||
| 高田北城 | |||
| 黒埼 | 新潟翠江 | (０４年に定時・通信へ改編) | |
| 佐渡 | |||
| 佐渡総合 | |||
| 三条 | |||
| 三条東 | |||
| 三条商 | |||
| 三条工 | 新潟県央工 (０４年開校) |
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| 燕工 | |||
| 糸魚川 | |||
| 糸魚川白嶺 | |||
| 十日町 | |||
| 十日町総合 | |||
| 小出 | |||
| 小千谷 | |||
| 小千谷西 | |||
| 松代 | |||
| 上越 | |||
| 新井 | |||
| 新潟 | |||
| 新潟向陽 | |||
| 新潟工 | |||
| 新潟江南 | |||
| 新潟産大附 | |||
| 新潟商 | |||
| 新潟西 | |||
| 新潟青陵 | |||
| 新潟第一 | |||
| 新潟東 | |||
| 新潟東工 | |||
| 新潟南 | |||
| 新潟北 | |||
| 新潟明訓 | |||
| 新津 | |||
| 新津工 | |||
| 新津南 | |||
| 新発田 | |||
| 新発田商 | |||
| 新発田中央 | |||
| 新発田農 | |||
| 新発田南 | 新発田南 | ||
| 中条工 | |||
| 水原 | 阿賀野 | ||
| 西越 | 出雲崎(未創部) | (０２年に定時制に編組の為、校名改称) | |
| 西新発田 | |||
| 西川竹園 | (廃部) | ||
| 川西 | |||
| 相川 | |||
| 村松 | |||
| 村上 | |||
| 村上桜ケ丘 | |||
| 中越 | |||
| 中条 | |||
| 中条工 | |||
| 長岡 | |||
| 長岡向陵 | |||
| 長岡工 | |||
| 長岡高専 | |||
| 長岡商 | |||
| 長岡大手 | |||
| 長岡農 | |||
| 直江津 | |||
| 直江津工 | 上越総合技術 | (０３年に高田工と統合) | |
| 津川 | 阿賀黎明 | (０２年に中高一貫の為、校名改称) | |
| 津南 | 津南中等 | (０８年に閉校) | |
| 帝京長岡 | |||
| 東京学館新潟 | |||
| 栃尾 | |||
| 日本文理 | |||
| 柏崎工 | |||
| 柏崎常盤 | |||
| 柏崎商 | 柏崎総合 | (０４年に柏崎農と統合) | |
| 柏崎総合 | (すでに存在するので、削除) | ||
| 白根 | |||
| 分水 | |||
| 豊栄 | |||
| 北越 | |||
| 堀之内 | |||
| 有恒 | |||
| 与板 | 正徳館 | ||
| 両津 | |||
| 六日町 | 六日町 | ||
| 湯沢 | |||
| 万代 | |||
| 安塚 | (０５年に創部) |